Липиды играют важную роль в обмене веществами и энергией между клеткой и внешней средой. Ученые разработали программу PCAlipids, которая способна анализировать их динамику и представлять информацию в виде наглядных графиков. Эти инструменты значительно ускоряют исследование воздействия различных веществ и условий на липиды.
Суть программы в том, что она анализирует структуру отдельных молекул липидов в конкретный момент, а также описывает изменения конформаций во времени. Для этого используется метод главных компонент, который позволяет выделить наиболее значимые элементы в данных. Появление таких экспериментальных данных позволит сравнить вычисленные с помощью компьютерного моделирования липидов величины с реальной жизнью и таким образом улучшить параметры моделирования.
PCAlipids сначала ищет группы атомов, двигающихся вместе. Первый базисный вектор новой системы координат определяет включающее наибольшее число атомов липида коллективное движение. Второму вектору соответствует следующее по значимости коллективное движение, и так дальше.
